在工业冷水机中，压缩机质量的好坏决定着冷水机的工作效率是否优良，同时压缩机在冷水机的今后售后维修中也占有很重要的位置，一旦出现故障，将会提高企业维修冷水机的费用提高。正常工作情况下，工业冷水机制冷压缩机应该吸入制冷工质的干蒸气，若是制冷工质流量大、热负荷变化太快、操作不当都可能吸入湿蒸气，或者液体工质，如果进入的液体太多，来不及从排气阀排出，高压形成的液击会造成气缸、气阀、活塞、连杆等零件损坏。建议可采取的保护措施是安装气液分离器，使夹带在低压蒸气中的液体分离出来，保证压缩机的干行程；安装油加热器，在压缩机起动前对润滑油加入，降低溶在润滑油中的制冷剂量；或将气阀组件用一弹簧紧压在气缸端部，形成假盖；

冷水机吸排气压力的控制：如果排气压力超过给定值，高压控制部分切断压缩机电源，压缩机停机；吸气压力低于给定值，低压控制部分切断压缩机电源，使其停机，并发出报警信号。

安全阀：为防止制冷剂泄漏至大气，一般采用闭式安全阀，安全阀设置在冷水机组压缩机排气腔和吸气腔之间的管路上。

安全膜：冷水机安全膜片安装在吸气、排气腔之间，吸排气压力差超过规定值时，膜片破裂，排气压力降低(需在吸气腔侧装滤网，防止破碎膜片落入吸气腔)。

润滑油压差控制器：冷水机把液压泵入口与液压泵出口分别和润滑油压差控制器上的低压入口、高压出口接通，当液压泵出、入口之间的压力差过高或过低时，控制器就会切断压缩机电源，电动机停止运转，保护冷水机压缩机。

冷水机内置电动机的保护，为更进一步确保电动机不过热，除了正确使用，注意维修外，建议可以安装过热继电器；冷水机常用的三相电动机缺相的话会导致电动机无法起动或过载，可采用过载继电器避免电动机因缺相损坏。冷水机排气温度保护方法主要是将温控器安放在靠近排气口处，感应到排气温度过高时，温控器动作切断电路；冷水机引起机组的壳体温度过高主要因为冷凝器的换热能力不足，建议检查冷凝器的风量或水量、水温是否合适，或是制冷系统内混入空气或其它不凝性气体等等，需要仔细观察并检测。